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Descripción de la prueba:

La prueba de expansión repetida de demencia frontotemporal y esclerosis lateral amiotrófica relacionada con C9orf72 analiza las expansiones repetidas de hexanucleótido ( GGGGCC ) dentro de una región intrónica del gen C9orf72. Las expansiones repetidas patógenas en C9orf72 son la causa hereditaria más común de demencia frontotemporal ( DFT ), una condición neurodegenerativa caracterizada por un deterioro cognitivo y conductual progresivo, y esclerosis lateral amiotrófica ( ELA ), una condición neurodegenerativa progresiva que involucra la pérdida de neuronas motoras superiores e inferiores. El análisis repetido de expansión del gen C9orf72 puede ayudar a confirmar un diagnóstico clínico, predecir el pronóstico y la progresión de la enfermedad, facilitar la detección temprana de síntomas, informar sobre planificación familiar y asesoramiento genético, o promover la inscripción en ensayos clínicos.

Método de información del ensayo
Esta prueba está diseñada para detectar y categorizar unidades repetidas de hexanucleótido (GGGGCC) en el intrón 1 del gen C9orf72. Para este gen no se realizan análisis de otros tipos de variantes u otras regiones. Las limitaciones específicas en el análisis de este gen se incluyen en la lista de limitaciones específicas de genes.
El número de unidades repetidas de hexanucleótidos en el intrón 1 del gen C9orf72 se evalúa mediante PCR con cebado repetido (RP-PCR) con cebadores marcados con fluorescencia, seguido de un análisis del tamaño de los fragmentos de los amplicones resultantes mediante electroforesis capilar (CE). Este ensayo detecta y representa adecuadamente la gran mayoría de los indeles directamente aguas abajo de la región repetida que ocurren en aproximadamente el 3% de la población general y el 20-25% de los individuos con una expansión en esta región (PMID: 27936955). Se utiliza una ronda secundaria de RP-PCR + CE, que utiliza un conjunto de cebadores que no se superponen para amplificar el locus desde la dirección opuesta, para confirmar la llamada inicial en el caso de tamaños de alelos sospechosos de 22 o más unidades repetidas. Esta prueba puede determinar con precisión (+/-1 unidad de repetición) el tamaño de repetición hasta 31 unidades de repetición (límite de mutación patógena completa), pero no está diseñada para determinar el número exacto de unidades de repetición por encima de 31.
Las expansiones de repetición detectadas en C9orf72 son interpretado utilizando una versión modificada del marco de clasificación de variantes Sherloc de Invitae. Rangos de tamaño de repetición: Benigno (rango normal): <25 unidades de repetición, Incierto: 25-30 unidades de repetición, Patógeno (mutación completa): >=31 unidades de repetición. Las longitudes de repetición de los alelos normales e inciertos se dimensionan y se incluyen en el informe. No se informa el tamaño exacto de los alelos de expansión de más de 30 repeticiones (mutaciones completas).
Limitaciones y descargo de responsabilidad
Según los resultados del estudio de validación y la literatura anterior, se espera que este ensayo alcance una sensibilidad y especificidad analítica >95 % para la detección de expansión repetida de hexanucleótidos. En casos raros, un individuo puede albergar variación de secuencia (inserciones/eliminaciones) en la región aguas abajo del locus de expansión de repetición GGGGCC. Aunque este ensayo detecta y representa adecuadamente la gran mayoría de los indeles directamente aguas abajo de la región repetida, en casos raros es posible que no podamos amplificar ambos alelos mediante PCR y se puede informar un resultado falso negativo en el que solo se detecta un único tamaño de alelo. llamado (presunta homocigosidad). Debido al mosaicismo somático, el tamaño de repetición identificado en el ADN aislado de sangre periférica, células bucales o saliva puede no reflejar el tamaño de repetición en tejidos no analizados (p. ej., cerebro). Además, un resultado negativo no descarta definitivamente la presencia de una expansión en estado mosaico, ya que la prueba actual no está validada para detectar variantes de mosaico de bajo nivel. En casos muy raros (como neoplasia hematolinfoide circulante, trasplante de médula ósea, transfusión de sangre reciente o contaminación de células maternas), es posible que el ADN analizado no represente el genoma constitucional del paciente. Esta prueba no evalúa el estado de metilación.
Esta prueba está destinada a detectar variantes de la línea germinal únicamente. Es posible que no sea posible resolver completamente ciertos detalles sobre las variantes, como el mosaicismo, las fases o la ambigüedad del mapeo. Este informe refleja el análisis de una muestra de ADN genómico extraída. En casos muy raros (como neoplasia hematolinfoide circulante, trasplante de médula ósea, transfusión de sangre reciente o contaminación de células maternas), es posible que el ADN analizado no represente el genoma constitucional del paciente.

Amplios trastornos probados:

  • Demencia frontotemporal ( DFT )
  • Esclerosis lateral amiotrófica ( ELA )

Genes analizados en este panel:

C9orf72

Expansión repetida de demencia frontotemporal y esclerosis lateral amiotrófica

$20,000.00Precio
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